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基因相互作用網絡圖

Demo 結果

Demo 結果

結果解讀

上圖中節點的大小表示的是基因的 degree,顏色代表上下調的信息,邊的顏色或者線型代表是相互作用的來源。


基因相互作用網絡圖介紹

基因網絡是一組基因的集合體,這些基因通過相互協作來控制生物體重要的生命過程。我們將客戶關注基因進行基于實驗驗證,其他親緣物種數據庫檢索、文獻挖掘等多種信息進行基因互作網絡的構建,找到關鍵核心基因。

分析要求

客戶關注的 mRNA(如差異基因)。

提供結果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進行細節調整;

3、文本文件:基因之間的互作關系,關鍵調節基因的排序(如 betweenness centrality)。

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