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SureSelectXT 甲基化靶向序列捕獲平臺（Methyl-Seq) 是安捷倫公司推出的甲基化發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)。該平臺為甲基化基因組區(qū)域研究提供了具有單堿基分辨率的高度可靠的方法。現(xiàn)有目錄化產(chǎn)品包括人、小鼠和大鼠甲基化測序設(shè)計。該產(chǎn)品相比常見的甲基化檢測平臺具有獨到的優(yōu)勢。
通過檢測單獨的 CpG 可獨具特色地提供比甲基化芯片更多的信息，相比全基因組重亞硫酸鹽測序，可提高通量并降低成本。可發(fā)現(xiàn)限制性內(nèi)切酶及免疫沉淀所不能檢測的甲基化區(qū)域。
廣泛應(yīng)用于大小鼠的藥物模型，干細胞研究、腫瘤和其他復(fù)雜疾病研究，特別適用于大小鼠物種的全表觀基因組的標志物發(fā)現(xiàn)和機制探尋。
作為 Agilent 公司的認證服務(wù)商，伯豪采用穩(wěn)定的 SureSelect 捕獲系統(tǒng)進行甲基化捕獲；
具有豐富的表觀功能機制和生物標志物篩選研究經(jīng)驗，幫助客戶發(fā)表多篇高分文章；
專業(yè)報告解讀系統(tǒng)，對科研應(yīng)用支持良好。
樣品類型：人、小鼠和大鼠；
樣品純度：OD 260/280 值應(yīng)在 1.8～2.0 之間；RNA 應(yīng)去除干凈；
樣品濃度：使用 Qubit 準確定量 DNA 濃度；
樣品總量：每個樣品 DNA 起始總量不少于 1ug。
案例：《Nature》主刊報道胚胎模型的甲基化研究
2i 是 Mek1/2 和 Gsk3β 的抑制劑，L 是白血病抑制因子，S/L 是血清和白血病抑制因子，2i/L 的短期處理可以將小鼠胚胎干細胞（ES）誘導(dǎo)為與著床前胚胎內(nèi)細胞團（ICM）相似的狀態(tài)。同時延長 2i/L 處理時間，可導(dǎo)致小鼠 ES 細胞中一系列不可逆的表觀遺傳和基因組變化，并損害其發(fā)育潛力，而這一影響是由長時間抑制 Mek1/2 引發(fā)的。
結(jié)果表明，2i/L ES 細胞的衍生可導(dǎo)致 DNA 甲基化的廣泛降低，包括配子來源的甲基化。這些胚胎干細胞在胚胎和胎盤發(fā)育過程中表現(xiàn)出損傷，說明了 2i/ L 建立的胚胎干細胞在多能干細胞質(zhì)量方面的局限性。作者的發(fā)現(xiàn)對于理解人類幼稚型多能干細胞在治療應(yīng)用和疾病建模方面的具有重要意義，因為在這些細胞中往往丟失印記和卵母細胞來源的甲基化記憶。作者還發(fā)現(xiàn)，早期傳代的雌性 a2i/L ES 細胞和 t2i/L ES 細胞保留了配子來源的 DNA 甲基化和自主發(fā)育潛能。作者認為這些胚胎干細胞可以作為另一種細胞培養(yǎng)平臺，用于早期胚胎發(fā)生的生物學(xué)研究。
Yagi M, Kishigami S, Tanaka A, et al. Derivation of ground-state female ES cells maintaining gamete-derived DNA methylation[J].Nature, 2017, 548(7666): 224.
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