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共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖

Demo 結(jié)果

Demo 結(jié)果

Demo 結(jié)果 2

結(jié)果解讀

網(wǎng)絡(luò)圖為篩選出的核心基因之間的關(guān)系,通過圖論的方法計(jì)算出關(guān)鍵基因,并通過關(guān)鍵基因的共表達(dá)基因預(yù)測出其功能。

共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

根據(jù)基因表達(dá)信號值的動(dòng)態(tài)變化,計(jì)算基因間的共表達(dá)關(guān)系,得到基因間的表達(dá)調(diào)控關(guān)系及調(diào)控方向,從而構(gòu)建基因的表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。利用共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖,研究者可通過分析基因調(diào)控能力,獲得樣本隨實(shí)驗(yàn)變化的核心調(diào)控基因。

分析要求

每組數(shù)據(jù) 3 個(gè)或 3 個(gè)以上生物學(xué)重復(fù)并且為差異基因或者關(guān)注的部分基因。

提供結(jié)果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進(jìn)行細(xì)節(jié)調(diào)整;

3、文本文件:基因之間共表達(dá)相關(guān)性以及顯著性,基因核心共表達(dá)的排序。

-END-

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