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microRNA 與靶基因網(wǎng)絡(luò)圖

Demo 結(jié)果

圖中顯示了 microRNA 與 mRNA 之間的關(guān)系

結(jié)果解讀

結(jié)果中顯示了 microRNA 與 mRNA 之間的關(guān)系,圖中 microRNA 調(diào)控的靶基因越多,說(shuō)明 microRNA 影響了這一群靶基因的功能;靶基因被多個(gè) microRNA 調(diào)控,說(shuō)明該基因?yàn)楹诵牡幕颉?/font>


microRNA 與靶基因網(wǎng)絡(luò)圖介紹

將顯著性功能與顯著性 Pathway 所包 含的靶基因取交集后與 microRNA 構(gòu)建 microRNA 靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),可以在全局的水平上直觀的反應(yīng)基因之間的相互關(guān)系,同時(shí)反映了基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的穩(wěn)定性。根據(jù)網(wǎng)絡(luò)中 microRNA 的位置函數(shù)計(jì)算出 microRNA 在網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)系強(qiáng)度,即 microRNA 的網(wǎng)絡(luò)特征值。特征值高 microRNA 處于網(wǎng)絡(luò)的樞紐性地位,該 microRNA 調(diào)控能力強(qiáng),對(duì)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和樣本性狀有重要的調(diào)控價(jià)值,同時(shí)從網(wǎng)絡(luò)中也可以得到被 microRNA 調(diào)控的關(guān)鍵靶基因。

分析要求

microRNA 進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè)并且對(duì)靶基因進(jìn)行篩選后。

提供結(jié)果

1、圖片文件(Network 圖),包括 png,PDF 格式;

2、Cytocape 文件:可以 cytoscape 打開進(jìn)行細(xì)節(jié)調(diào)整;

3、文本文件:microRNA 與靶基因的關(guān)系,microRNA 與靶基因的核心基因篩選。

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