好不容易拿到了自己的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，心情激動、躍躍欲試，想趕快去實施一下自己的idea，可是又不會寫代碼，只能干等著？當(dāng)然不是，其實你完全可以實現(xiàn)不寫代碼完成自己大部分數(shù)據(jù)挖掘的工作。

在胚胎發(fā)育過程中，造血干細胞（HSCs）需要迅速分化為成熟的血細胞。當(dāng)前主要通過小鼠和體外模型系統(tǒng)來了解胎兒造血干/祖細胞（HSPCs）。研究表明在發(fā)育過程中，胎兒的造血功能包括不同器官中稀有造血干細胞的分化、遷移。人類確定性造血作用始于背主動脈造血簇中HSCs的出現(xiàn)，這些HSCs在4 PCW首先定位于胎兒肝臟并進行擴張，在10.5 PCW時，造血部位轉(zhuǎn)移至骨髓并建立成人造血功能。

扎根于細胞生物學(xué)領(lǐng)域40余年，BD公司在流式和抗體領(lǐng)域占據(jù)著主導(dǎo)地位。作為目前單細胞研究常用的技術(shù)之一，BD公司2018年推出的Rhapsody?單細胞分析平臺克服了傳統(tǒng)檢測的局限性，能夠?qū)ι先f個單細胞的數(shù)千個表達基因同時進行定量檢測，鑒定和表征新型和罕見細胞類型，有助于理解從免疫學(xué)到腫瘤學(xué)等多個領(lǐng)域的生物學(xué)過程。

盡管轉(zhuǎn)錄組研究已經(jīng)獲得很多令人激動的進展，但它終歸還是一個高度協(xié)調(diào)的、受表觀基因組調(diào)控的基因表達程序的副產(chǎn)物。

研究人員使用空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(spatial transcriptome，ST)來識別,阻斷腫瘤異質(zhì)性的來源，提供識別新的生物標(biāo)志物的能力，并深入了解腫瘤細胞、脂肪組織、血管、三級淋巴結(jié)構(gòu)和TME間基質(zhì)之間的動態(tài)相互作用。

過往研究報道了早期胎兒腸上皮細胞動力學(xué)與IBD之間的聯(lián)系，提示IBD患者的腸上皮中可能重現(xiàn)了類似于胎兒的轉(zhuǎn)錄程序。因此，解讀腸道發(fā)育是預(yù)防和治療此類疾病的關(guān)鍵一步。

DNA甲基化標(biāo)志物作為標(biāo)志物的成功案例有MGMT啟動子甲基化可預(yù)測膠質(zhì)母細胞瘤和血漿中甲基化SEPTIN 9(SEPT9)檢測無癥狀結(jié)直腸癌，這些都已被納入臨床指南并轉(zhuǎn)化為商業(yè)化臨床試驗。

識別人體器官細胞的特征及其相互作用對研究與疾病相關(guān)的生物學(xué)機制具有重要意義。

擬時序分析（pseudo-time），它指通過構(gòu)建細胞間的變化軌跡來重塑細胞隨著時間的變化過程。用于擬時序分析的軟件和算法很多，目前文章中用到多的是Monocle軟件，這也是是CNS主流期刊的常用軟件。

微生物組與代謝組的數(shù)據(jù)整合方法按照是否基于已有知識可以分為統(tǒng)計學(xué)檢驗方法和知識驅(qū)動的整合分析方法。